時間:2022-09-20 10:25:05
序論:寫作是一種深度的自我表達。它要求我們深入探索自己的思想和情感,挖掘那些隱藏在內(nèi)心深處的真相,好投稿為您帶來了七篇信息學論文范文,愿它們成為您寫作過程中的靈感催化劑,助力您的創(chuàng)作。
藥學信息學計算機綜合實驗課程體系建設
(1)重視實用性課程實驗的開設是藥學信息學課程體系創(chuàng)新與實踐的重要特點。藥學信息學專業(yè)計算機基礎課程實驗設計的目標是使學生能夠達到在藥學研究領域掌握計算機應用的專業(yè)背景知識及能力。藥學信息應用型人才培養(yǎng)體系的藥學信息學課程體系的實驗內(nèi)容包括“計算機基礎”、“程序設計技術與應用”以及高級課程“計算機在藥學中的應用”等三個方面的具體實施項目。(2)根據(jù)藥學專業(yè)對計算機人才的需求及應用,結(jié)合計算機基礎教學的具體內(nèi)容及多年的教學實踐,將藥學信息學課程體系試驗設計分為三組典型實驗:①計算機基礎操作典型實驗;②計算機程序設計典型實驗;③計算機綜合應用典型實驗。三組實驗的設計與實施具有層次鮮明、條理清晰、結(jié)構(gòu)完善、循序漸進等特點。
構(gòu)建課程網(wǎng)絡教學平臺建設
(1)建立了以多元化、交互式學習環(huán)境為主要特色的多功能網(wǎng)站,建立完善的多媒體教學資源庫,該教學資源庫是面向全校學生,集學生自學、師生交流、網(wǎng)絡答疑等多功能于一體綜合網(wǎng)絡教學平臺。(2)該教學資源庫中包括教師課件、課外閱讀資料、相關資料圖片,以及教學過程中使用到的軟件、教學錄像等,并且通過網(wǎng)站平臺免費提供藥學信息學體系的教學大綱、教材、教學方案、教學課件、實驗課程設計、教學資源素材,全面公開并共享教學資源,突破時間和地點的限制,為學生自主學習提供幫助,教學方式由目前的多媒體教學逐步轉(zhuǎn)變?yōu)榫W(wǎng)絡化教學。(3)在“構(gòu)建藥學信息學課程體系創(chuàng)新與實踐”過程中,制作了系列課程相應的PowerPoint演示文檔,并建立的多個相應的實例數(shù)據(jù)及應用軟件用法介紹視頻,并提供大量相關多媒體參考、學習資料,方便藥學信息學專業(yè)的學生快速查找和深入學習各章節(jié)的內(nèi)容,同時也提供了部分可執(zhí)行的藥學信息學應用程序,有助于加深學生對書本知識的理解,而且也為藥學信息學實驗數(shù)據(jù)處理及模擬提供了有利幫助。(4)建立并豐富了藥學信息學系列課程的測試大型試題庫,并開發(fā)設計了聯(lián)網(wǎng)在線機考測評軟件,面向全校學生,實現(xiàn)了無紙化考試。通過以下綜合實驗操作技能的綜合測評,如藥學常用軟件工具練習及開發(fā)環(huán)境構(gòu)建、基于Excel和VisualBasic的藥學試驗設計、基于Matlab和VisualBasic的LD50計算、基于Excel和Matlab的藥學實驗數(shù)據(jù)分析等實驗檢測項目,健全了以檢驗實際操作能力為核心的考試測評機制、以考促學的積極作用,豐富完善了藥學信息學課程體系建設的重要環(huán)節(jié)。
關鍵詞:計算機圖像處理技術;數(shù)字全息
0引言
全息技術是物理學中一重要發(fā)現(xiàn),越來越多的應用于各個行業(yè)。伴隨著CCD技術和計算機技術的發(fā)展,全息技術也得到一次質(zhì)的飛躍,從傳統(tǒng)光學全息到數(shù)字全息。傳統(tǒng)光學全息將物光和參考光干涉得到全息照片來記錄光的振幅和相位信息,而數(shù)字全息則用CCD記錄物光和參考光的干涉,形成數(shù)字全息圖,再通過計算機圖像處理技術處理全息圖。因此,影響數(shù)字全息技術發(fā)展有兩個重要方面:CCD技術和計算機圖像處理技術。本文將從計算機應用方面闡述圖像處理技術在全息中的應用。
1圖像處理技術
圖像是現(xiàn)代社會人們獲取信息的一個主要手段。人們用各種觀測系統(tǒng)以不同的形式和手段獲得圖像,以拓展其認識的范圍。圖像以各種形式出現(xiàn),可視的、不可視的,抽象的、實際的,計算機可以處理的和不適合計算機處理的。但究其本質(zhì)來說,圖像主要分為兩大類:一類是模擬圖像,包括光學圖像、照相圖像、電視圖像等。它的處理速度快,但精度和靈活性差。另一類是數(shù)字圖像。它是將連續(xù)的模擬圖像離散化后處理變成為計算機能夠辨識的點陣圖像。從數(shù)字上看,數(shù)字圖像就是被量化的二維采樣數(shù)組。它是計算機技術發(fā)展的產(chǎn)物,具有精度高、處理方便和重復性好等特點。
圖像處理就是將圖像轉(zhuǎn)化為一個數(shù)字矩陣存放在計算機中,并采用一定的算法對其進行處理。圖像處理的基礎是數(shù)學,最主要任務就是各種算法的設計和實現(xiàn)。目前,圖像處理技術已經(jīng)在很多方面有著廣泛的應用。如通訊技術、遙感技術、生物醫(yī)學、工業(yè)生產(chǎn)、計算機科學等等。根據(jù)應用領域的不同要求,可以將圖像處理技術劃分為許多分支,其中比較重要的分支有:①圖像數(shù)字化:通過采樣和量化將模擬圖像變成便于計算機處理的數(shù)字形式。③圖像的增強和復原:主要目的是增強圖像中的有用信息,削弱干擾和噪聲,使圖像清晰或?qū)⑥D(zhuǎn)化為更適合分析的形式。③圖像編碼:在滿足一定的保真條件下,對圖像進行編碼處理,達到壓縮圖像信息量,簡化圖像的目的。以便于存儲和傳輸。④圖像重建:主要是利用采集的數(shù)據(jù)來重建出圖像。圖像重建的主要算法有代數(shù)法、傅立葉反投影法和使用廣泛的卷積反投影法等。⑤模式識別:識別是圖像處理的主要目的。如:指紋鑒別、人臉識別等是模式識別的內(nèi)容。當今的模式識別方法通常有三種:統(tǒng)計識別法、句法結(jié)構(gòu)模式識別法和模糊識別法。⑥計算機圖形學:用計算機將實際上不存在的,只是概念上所表示的物體進行圖像處理和顯現(xiàn)出來。
2計算機圖像處理技術在全息學中的應用
圖像處理技術在全息中的應用主要表現(xiàn)在:一是計算全息,基于計算機圖形學將計算機技術與光全息技術結(jié)合起來,通過計算機模擬、計算、處理,制作出全息圖。因此它可以記錄物理上不存在的實物。二是利用圖像的增強和復原,圖像編碼技術等對數(shù)字全息圖像質(zhì)進行提高以及實現(xiàn)的各種算法。它的應用大致可以分為兩大類,即空域法和頻域法:①空域法:這種方法是把圖像看作是平面中各個像素組成的集合,然后直接對這一二維函數(shù)進行相應的處理。空域處理法主要有下面兩大類:一是領域處理法。其中包括梯度運算(GradientAlgorithm),拉普拉斯算子運算(LaplacianOperator),平滑算子運算(SmoothingOperator)和卷積運算(ConvolutionAlgorithm)。二是點處理法。包括灰度處理(greyprocessing),面積、周長、體積、重心運算等等。②頻域法:數(shù)字圖像處理的頻域處理方法是首先對圖像進行正交變換,得到變換頻域系列陣列,然后再施行各種處理,處理后再反變換到空間域,得到處理結(jié)果。這類處包括:濾波、數(shù)據(jù)壓縮、特征提取等處理。
3模擬實驗
本文運用matlab軟件,利用圖像處理技術,編寫了程序,以模擬計算全息和實現(xiàn)全息圖像的濾波。圖1是計算全息實現(xiàn)流程圖。
本文將運用matlab程序設計語言實現(xiàn)計算全息的制作、再現(xiàn)過程。標有“涉”一字,圖像尺寸為1024像素×1024像素;。模擬實驗中用到的參數(shù)為:激光模擬了氦氖激光器,波長為638.2nm;再現(xiàn)距離為40cm;因為原始物圖的尺寸用像素為單位表示,所以像素分辨率為1。:
從模擬實驗中可以看出,數(shù)字全息的處理過程其實就是計算機圖像處理在全息技術的應用過程。利用計算機圖像處理技術對全息圖進行了記錄,將物光和參考光干涉得到了全息圖。并利用圖像的增強和復原對圖像進行了處理,以消除噪聲,得到更好的全息再現(xiàn)象。
本文僅模擬了計算全息的實現(xiàn)和再現(xiàn)過程,其實,計算機圖像處理在全息技術中的應用是全方位的,用實驗方法得到的全息圖中包含了更多的其他無用信息(噪聲),圖像處理技術在這里就顯得尤為重要。隨著計算機圖像處理技術的進一步發(fā)展,全息技術必然會迎來新的一輪發(fā)展和飛躍。
參考文獻:
[1]周燦林,亢一瀾.數(shù)字全息干涉法用于變形測量.光子學報,2004,13(2):171-173.
[2]劉誠,李銀柱,李良鈺等.數(shù)字全息測量技術中消除零級衍射像的方法[J].中國激光,2001,A28(11):1024-1026.
關鍵詞:專業(yè)學位;實踐能力;培養(yǎng)
中圖分類號:G643 文獻標志碼:A 文章編號:1674-9324(2013)07-0229-02
現(xiàn)代科學技術突飛猛進,新技術、新理論、新知識日新月異,職業(yè)分工越來越細,職業(yè)的技術含量和專業(yè)化程度越來越高,對專門人才的需求呈現(xiàn)出大批量、多規(guī)格、高層次的特點。隨著研究生規(guī)模的不斷擴大和社會需求的不斷變化,碩士研究生的就業(yè)去向已更多地從教學、科研崗位轉(zhuǎn)向?qū)嶋H工作部門。同時以工科為主體的高校,面臨著原有部屬院校資源優(yōu)勢逐步喪失,需要有效提高研究生的工程應用能力和社會適應能力、提升研究生教育質(zhì)量等諸多困境。而擴大發(fā)展全日制專業(yè)學位研究生的培養(yǎng)無疑是適應國家經(jīng)濟建設和社會發(fā)展對高層次應用型人才的迫切需要,積極發(fā)展具有中國特色的專業(yè)學位教育的必然結(jié)果。但是如何強化專業(yè)學位研究生實踐能力卻成為了很多學校面臨的主要問題。本文從筆者所在的以信息學科為特色和優(yōu)勢的院校培養(yǎng)專業(yè)學位研究生的實際出發(fā),以電子信息學科群專業(yè)學位研究生的培養(yǎng)為例,探析了強化專業(yè)學位研究生實踐能力的培養(yǎng)體系的構(gòu)建。
一、適應電子信息行業(yè)特點,明確專業(yè)學位研究生培養(yǎng)目標定位
在數(shù)字化浪潮席卷全球以來,電子信息技術幾乎無處不在,以電子、信息、通信、控制等領域的多個學科所構(gòu)成的電子信息學科群的相關研究領域逐步擴大,研究重點不斷變化,學科自身也不斷發(fā)展、延伸和擴展,學科內(nèi)容與分支急劇膨脹。同時電子信息產(chǎn)業(yè)又是以人的智力勞動為主的高技術產(chǎn)業(yè),人才是最重要的資本。目前我國電子信息產(chǎn)業(yè)面臨著人才總量嚴重不足和人才層次結(jié)構(gòu)不合理等問題,缺乏高端技術專家和復合型人才。隨著我國電子信息產(chǎn)業(yè)的壯大,競爭的加劇,技術和管理方面的復合型人才成為電子信息企業(yè)緊缺人才,也是各企業(yè)爭相搶奪的資源。國家對電子信息行業(yè)的高層次應用型人才急劇增加,必然要求高等院校培養(yǎng)出更多更優(yōu)秀的專業(yè)學位研究生。借鑒國內(nèi)外高等工程教育人才培養(yǎng)模式的成功經(jīng)驗,可以確立電子信息領域?qū)I(yè)學位研究生培養(yǎng)應該以“實踐能力”為重點任務,堅持“以生為本,創(chuàng)新為先”的電子信息領域創(chuàng)新人才培養(yǎng)理念,并將研究生實踐能力培養(yǎng)貫穿于研究生培養(yǎng)的全過程。
二、理順教、學、研關系,構(gòu)建專業(yè)學位研究生培養(yǎng)體系
研究生培養(yǎng)方案是制訂培養(yǎng)計劃、開展研究生培養(yǎng)和學位授予工作的最基本性、綱領性文件,也是進行研究生培養(yǎng)質(zhì)量管理、檢查與評估等工作的重要依據(jù),是保證研究生培養(yǎng)質(zhì)量的標準,指引著研究生培養(yǎng)的方向,影響著一定時期內(nèi)所培養(yǎng)研究生的知識結(jié)構(gòu)、能力水平、綜合素質(zhì)以及研究生就業(yè)競爭力和學校的聲譽等。所以首先要制訂符合專業(yè)學位研究生的培養(yǎng)方案。面對社會多樣化需求和學生能力發(fā)展需要,在“以生為本,創(chuàng)新為先”電子信息領域創(chuàng)新人才培養(yǎng)理念的指引下,需要進一步理順教、學、研的關系,構(gòu)建一套適合于電子信息學科群專業(yè)學位研究生成長的人才培養(yǎng)體系方案。培養(yǎng)體系方案中,要注重研究生實際工作能力和創(chuàng)新精神的培養(yǎng)。實際工作能力和創(chuàng)新精神的基石,就是實踐能力。圍繞“實踐能力”這一專業(yè)學位研究生的核心競爭力,創(chuàng)建“雙創(chuàng)并重,三環(huán)一體”的理論與實踐相結(jié)合的電子信息領域創(chuàng)新人才培養(yǎng)體系。
“雙創(chuàng)”即為“創(chuàng)新”“創(chuàng)業(yè)”。將實踐能力培養(yǎng)上升到創(chuàng)新能力、創(chuàng)業(yè)能力培養(yǎng)的高度。信息通訊技術的融合與發(fā)展推動了社會形態(tài)的變革,催生了知識社會,使得傳統(tǒng)的實驗室邊界逐步“融化”,進一步推動了創(chuàng)新模式的嬗變。研究生教育本身就是一種創(chuàng)新教育,圍繞“不斷提高國民素質(zhì)、培養(yǎng)適應不斷發(fā)展的社會需要的人才”這一教育總體目標,以新思維和新描述為特征的一種概念化過程,是為了研究生教育發(fā)展的需要,運用已知的信息,不斷突破常規(guī),發(fā)現(xiàn)或產(chǎn)生新穎、獨特的有社會價值或個人價值的新事物、新思想。運用創(chuàng)新思維可以找到多種解決方案,跳出傳統(tǒng)思維的框框,洞察發(fā)展趨勢,建立新的思維方法。創(chuàng)業(yè)是一項卓有抱負的選擇。創(chuàng)業(yè)是艱辛的,必須具備不怕吃苦、不怕失敗、艱苦奮斗的創(chuàng)業(yè)精神。創(chuàng)業(yè)更是一項系統(tǒng)工程,必須有精心的準備,更要有持之以恒的毅力。創(chuàng)新是創(chuàng)業(yè)的精神基礎,創(chuàng)業(yè)最好引用創(chuàng)新的成果,而創(chuàng)新又最好融合到創(chuàng)業(yè)的實踐中,這樣才能有利于發(fā)展。并以創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)能力提升為核心,構(gòu)建“三環(huán)一體”。
“三環(huán)”則是“教學、科研、論文”。在公共基礎課、專業(yè)基礎課、專業(yè)課和社會實踐等教學環(huán)節(jié)中滲透和強化實踐理念,構(gòu)建創(chuàng)新教學課程體系,注重學生形式邏輯思維、辯證邏輯思維、形象思維、直覺思維、靈感思維、發(fā)散思維、收斂思維、逆向思維、系統(tǒng)思維的培養(yǎng)。在教學環(huán)節(jié)加強實踐能力培養(yǎng),有助于培養(yǎng)研究生對社會的了解和認識,有助于提高研究生的動手能力和解決生產(chǎn)應用問題的能力,有助于幫助研究生進行自我認知,激發(fā)創(chuàng)新意識。
在科學研究環(huán)節(jié)中,密切產(chǎn)學研用相結(jié)合,拓寬研究課題渠道。搭建主動與國家級科研院所合作的“院地合作”、主動地向高新技術開發(fā)區(qū)、微電子工業(yè)區(qū)、特色工業(yè)園區(qū)等新興園區(qū)靠攏,與園區(qū)內(nèi)高新技術企業(yè)合作的“走進園區(qū)”、推進特色優(yōu)勢學科與相關技術領域的重要創(chuàng)新型企業(yè)的戰(zhàn)略合作的“校企聯(lián)盟”以及利用學校重大科技成果、深厚的學科基礎和人才優(yōu)勢,與政府投資機構(gòu)、企業(yè)和社會投資家,聯(lián)合創(chuàng)辦獨立面向市場的股份制高科技企業(yè)等的“創(chuàng)辦企業(yè)”等產(chǎn)學研合作教育平臺,構(gòu)建創(chuàng)業(yè)式研究實踐體系。
論文環(huán)節(jié)是研究生“教學、科研、論文”三環(huán)的核心。碩士學位論文工作的目的在于培養(yǎng)碩士生綜合運用科學理論知識解決本門學科內(nèi)的理論或?qū)嶋H問題的能力,是碩士生研究生在進行科學研究方面受到比較全面的訓練,以獲得從事科學研究或獨立擔負專門技術工作的技能。尤其是專業(yè)學位研究生,一定要重視解決實際問題的能力。專業(yè)學位研究生的論文工作應結(jié)合工作實際,注重論文工作應用價值、經(jīng)濟效益和社會效益。專業(yè)學位研究生學位論文必須強化應用導向,論文選題應來源于社會實踐或工作實際中的現(xiàn)實問題,有明確的實踐意義和應用價值。論文可以采用調(diào)研報告、規(guī)劃設計、產(chǎn)品開發(fā)、案例分析、項目管理等多種形式。
通過前面的教學環(huán)節(jié)、科研環(huán)節(jié)的訓練,在論文環(huán)節(jié)達到交叉融合,相輔相成,構(gòu)建理論與實踐相結(jié)合的均衡有效的專業(yè)學位研究生培養(yǎng)體系。課程學習和科研工作為完成高質(zhì)量學位論文打下了良好基礎。論文環(huán)節(jié)貫穿于專業(yè)學位研究生培養(yǎng)的始終,在教學和科研過程中,尋找論文的亮點工作,并以完成論文來指導課程的選修和科研過程。
三、創(chuàng)新教育管理方式,完善人才成長保障機制
通過研究管理機制、激勵機制,制定相關規(guī)章制度和政策,圍繞“研究生實踐能力培養(yǎng)”為核心,采取強有力措施,凝聚師生團隊、構(gòu)建學科科研大平臺等多重保障,解決電子信息領域高素質(zhì)創(chuàng)新人才培養(yǎng)體系實施的環(huán)境與保障問題,支撐人才的知識、能力、素質(zhì)的綜合培養(yǎng),切實保障人才實踐能力的提升和人才培養(yǎng)質(zhì)量的提高。大力實施研究生教育創(chuàng)新計劃(含創(chuàng)新成果獎勵、國內(nèi)外訪學交流、高水平研究生創(chuàng)新團隊培育、研究生科技創(chuàng)新基金等獎勵支持計劃),出臺助管、助研、助教“三助”支持計劃、研究自主創(chuàng)辦品牌學術活動支持等相關文件,引導和激勵研究生教育教學工作與生產(chǎn)實際相結(jié)合,并對研究生教育進行規(guī)范管理,建立和逐步完善“多維立體,保障到位”的電子信息領域創(chuàng)新人才培養(yǎng)激勵機制,為培養(yǎng)研究生實踐能力提供良好的制度保障;通過創(chuàng)新團隊,創(chuàng)新生師隊伍建設,為培養(yǎng)研究生實踐能力提供良好的團隊人員保障;通過一系列面向電子信息產(chǎn)業(yè)鏈的科研、教學大平臺的建設和完善,為培養(yǎng)研究生實踐能力提供了良好的平臺環(huán)境條件。
四、結(jié)語
英文名稱:Journal of Medical Informatics
主管單位:衛(wèi)生部
主辦單位:中國醫(yī)學科學院
出版周期:月刊
出版地址:北京市
語
種:中文
開
本:大16開
國際刊號:1673-6036
國內(nèi)刊號:11-5447/R
郵發(fā)代號:2-664
發(fā)行范圍:
創(chuàng)刊時間:1979
期刊收錄:
CA 化學文摘(美)(2009)
核心期刊:
期刊榮譽:
聯(lián)系方式
期刊簡介
《醫(yī)學信息學雜志》(月刊)創(chuàng)刊于1979年,由中國醫(yī)學科學院主辦。是國內(nèi)創(chuàng)刊最早的醫(yī)學信息方面的專業(yè)指導性刊物。自創(chuàng)刊之日起始終恪守理論與實踐相結(jié)合,普及與提高相并重,倡導服務創(chuàng)新,推動事業(yè)發(fā)展的辦刊宗旨。以報道醫(yī)學信息領域的信息研究、信息資源建設與利用等方面的理論方法、研究成果、現(xiàn)代技術應用等為主,形成了面向?qū)嵺`、注重新技術、追求新理論的特色,鑄就了求實創(chuàng)新的學術風格,成為中國醫(yī)學信息領域具有權(quán)威性與專業(yè)指導性的學術刊物。所載論文既反映了我國醫(yī)學信息事業(yè)發(fā)展歷程,又引領我國醫(yī)學信息事業(yè)發(fā)展方向,為我國醫(yī)學信息事業(yè)發(fā)展做出了重要貢獻。
江賜忠,美國衣阿華州立大學遺傳學博士,同濟大學特聘教授、博士生導師。先后獲得教育部“新世紀優(yōu)秀人才”、上海市科委“浦江計劃人才”、上海市教育發(fā)展基金會“曙光計劃人才”、上海市教委“東方學者”榮譽稱號與資助。在Nature、Genome Research、Nucleic Acids Research等著名國際學術期刊上發(fā)表SCI收錄論文37篇,單篇論文已被引用超過400次。出版國際英文專著的一個章節(jié)。
十月,Science以“生物信息學,神秘的新職業(yè)”為題發(fā)文,“在大數(shù)據(jù)時代,這是個有趣的地方,也是令人激動的時刻。”一位教授這樣評價道。
我們處在一個大數(shù)據(jù)的時代,由于高通量測序技術飛速發(fā)展,在生物醫(yī)學研究中已經(jīng)得到廣泛應用,每天都會產(chǎn)生海量數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)量如此之大,部分是由于思維方式已經(jīng)從數(shù)據(jù)的生成轉(zhuǎn)變?yōu)閿?shù)據(jù)的分析,因此就更需要有專家能夠用高效的方式去分析挖掘,讓其對科學家和臨床醫(yī)生具有意義,并最終惠及客戶和患者。
這些海量數(shù)據(jù)就象一堆沙子,生物信息學專家就好比淘金人,要從沙子中淘出金子來。美國衣阿華州立大學遺傳學博士,同濟大學特聘教授、博士生導師江賜忠就是一位致力于我國生物信息學發(fā)展的“淘金者”。
興趣成就夢想
人們常說,興趣是最好的老師,江賜忠正是在興趣的牽引下進入生物信息學領域的研究。
江賜忠說他每當念及童年時光,對大自然里的各種小動物都記憶猶新。夏天把抓來的螢火蟲放在紙疊的燈籠里,看它們一閃一閃地發(fā)光;觀注成群結(jié)隊的螞蟻有序地把蒼蠅一只一只地往洞里搬,從小就愛上這絢麗多彩大自然里各種可愛的小精靈。因此小學的自然課、中學的植物學與動物學都是他最喜歡的課,他從洋蔥表皮細胞顯微鏡觀察認識了生命微觀結(jié)構(gòu),由光合作用實驗開始了解生命奧秘。帶著對生物的喜愛與生命奧秘的好奇,江賜忠考大學時第一志愿選擇了生命科學。
后來在美國讀博士學位期間,對人類健康、中醫(yī)藥、當代科學研究方法、甚至是商業(yè)等都有很深影響的國際合作項目“人類基因組計劃”正在如火如荼地進行,也帶動對酵母、秀麗線蟲、果蠅等其它模式生物基因組測序,產(chǎn)生大量基因組測序數(shù)據(jù)。加上計算機軟硬件的迅速發(fā)展,逐漸產(chǎn)生了一門新興的交叉學科――生物信息學。這門學科主要是結(jié)合計算機、數(shù)學、統(tǒng)計等方法,從海量數(shù)據(jù)中挖掘出規(guī)律與有用的信息,用于解釋生物現(xiàn)象、闡述其機制、解決相關生物醫(yī)學問題。如鑒定出某種疾病發(fā)生發(fā)展中起重要作用的基因、潛在的藥物靶點等。
江賜忠所在的衣阿華州立大學在這期間成立了生物信息學專業(yè),“我有幸加入這個專業(yè),接受系統(tǒng)的生物信息學學習與技能訓練。其實我一直也很喜歡計算機。通過加入生物信息學專業(yè),正好圓了我學習計算機的夢。碰巧我的博士學位論文前半部分是做實驗獲得數(shù)據(jù),后半部分主要就用計算機進行分析所得的數(shù)據(jù)。”他告訴記者。
興趣和堅持,是通向科研成功的兩顆啟明星。因此,有興趣為始,還要以毅力相伴。博士畢業(yè)后,江賜忠就開始完全轉(zhuǎn)入專業(yè)的生物信息學分析。這樣,他無縫過渡到生物信息學與基因組學這個領域。2007年高通量測序技術開始興起,他參與到核小體、組蛋白等表觀遺傳高通量數(shù)據(jù)分析的項目中,掌握了高通量數(shù)據(jù)分析的最新技術。也正是高通量測序與染色質(zhì)免疫沉淀技術的興起,表觀遺傳組學研究取得突飛猛進的發(fā)展,成為當前生物醫(yī)學研究熱點,江賜忠也成為這個領域眾多研究者的一員。
科學無國界,科學家有自己的祖國
一個國家的科研水平與實力和國家的強大息息相關。在上世紀90年代早期及之前,中國國內(nèi)的工作想在《科學》、《自然》等國際頂尖學術期刊上發(fā)表基本上是個可望不可及的追求。但是,最近十幾年,國內(nèi)實驗室的工作每年都有多篇在《科學》、《自然》、《細胞》等國際頂尖學術期刊上發(fā)表。中國正在走向世界,他最希望的是中國的生物信息科學也能夠走在世界的最前列。
回國工作后,江賜忠主持參與了國家“973”重大科學研究計劃項目、國家自然基金委重大研究計劃與面上項目。根據(jù)中國出生缺陷防治報告,我國出生缺陷占新生兒的約5%,每年約有100萬缺陷兒出生,給家庭和社會造成極大負擔。導致缺陷兒的原因很大一部分與表觀遺傳紊亂有關。而核小體作為染色體的基本結(jié)構(gòu)單元,通過開放或屏蔽DNA序列來控制轉(zhuǎn)錄因子與DNA結(jié)合,從而調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄表達。核小體在基因組中定位的變化與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化是重要的表觀遺傳基因調(diào)控機制。核小體的正確定位與染色質(zhì)的正確結(jié)構(gòu)在胚胎發(fā)育中起著重要作用,但分子機制并不清楚。
鑒于此,江賜忠團隊聯(lián)合了國內(nèi)四家高校研究所,在生殖發(fā)育、表觀遺傳、與生物信息方面的杰出研究團隊,一起申請到“973”重大科學研究計劃項目“胚胎發(fā)育中的核小體重排與染色質(zhì)重塑”。該項目結(jié)合生物信息學手段,主要從胚胎與干細胞兩個層次來研究核小體定位與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)變化在胚胎發(fā)育中的作用機制,以期能夠獲得早期胚胎發(fā)育母源驅(qū)動向合子啟動轉(zhuǎn)化(MZT)這一重要過程、以及干細胞全能性維持與分化中核小體定位與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)變化模式及表觀遺傳基因調(diào)控機制,為降低出生缺陷率、提高我國人口健康水平奠定基礎。
目前,項目研究已經(jīng)取得一批成果。如染色質(zhì)重塑酶是影響核小體定位的重要因素之一。染色質(zhì)重塑酶缺失會導致果蠅胚胎發(fā)育停滯,但其分子機制并不清楚。在果蠅中Brahma由Brm基因編碼。為此,他們在果蠅三齡幼蟲中敲降Brm基因,以此研究核小體定位變化與全局基因表達譜變化。結(jié)果發(fā)現(xiàn),Brm敲降導致整個基因組核小體占有(occupancy)變化,全局基因組上核小體密度變低。相對照,Brm敲降對核小體的位置偏移影響較小,約75%的核小體偏移少于10bp。Brm敲降對核小體定位的固定性(即相位)也有影響。核小體定位偏移、丟失與獲得、相位變化都富集在基因啟動子區(qū)。Brm敲降還導致了基因5’端大量區(qū)域核小體串(即3個及以上連續(xù)核小體)發(fā)生變化。
有意思的是,這些區(qū)域上的基因在發(fā)育與形態(tài)發(fā)生上有重要功能。這一定程度上解釋了Brm敲降導致果蠅胚胎發(fā)育停滯的原因。這些區(qū)域上富含AT富有的轉(zhuǎn)錄因子的模體(motif),因此Brm敲降可能通過影響這些轉(zhuǎn)錄因子對DNA的結(jié)合,從而調(diào)控其靶基因活性,影響胚胎正常發(fā)育。該結(jié)果已發(fā)表在Nucleic Acids Research (2014)。
讓世界關注中國
江賜忠始終認為,一個人的力量不足為奇,只有集眾之力才能形成一股巨大的推動力量。他先后參加了2009年的The 16th Conversation for Journal of Biomolecular Structure and Dynamics,2010年的The 8th International Bioinformatics Workshop,2010年與2012年冷泉港亞洲會議Epigenetics, Chromatin & Transcription,2012年的International Workshop and Summer School on Crops等國際會議,同時他們也邀請了時為北卡羅來納州大學教堂山分校(University of North Carolina at Chapel Hill)的Jason Lieb教授等國內(nèi)外知名學者來校訪問交流。通過這些學術交流,他們充分了解相關領域國際上的最新研究動態(tài)與現(xiàn)狀,與國際接軌。
“生物信息學是門交叉學科,既要有牢固的生物學知識,又要有很強的數(shù)理知識與編程能力。要同時掌握這些跨學科知識與技能不是件容易的事情,這就造成這方面人才的匱乏。據(jù)我所知,我國目前設有本科生物信息學專業(yè)的高校并不多。幸運的是,我在的同濟大學生命學院有開設生物信息學本科專業(yè)。因此,我國很必要加強生物信息學專業(yè)人才的培養(yǎng)與儲備。”江賜忠對于人才的重視和渴望溢于言表。
南通大學地處江部的南通市,是江蘇省人民政府和交通運輸部共建的綜合性大學,南通大學的辦學歷史始于近代著名教育家、實業(yè)家張謇先生于1912年創(chuàng)辦的私立南通醫(yī)學專門學校,其“父教育、母實業(yè)”的教育思想與實踐,為南通的教育事業(yè)打下了堅實的基礎。
南通醫(yī)學院是國內(nèi)最早開設面向臨床信息學本科教學的高校。該校學科帶頭人董建成是較早就耕耘在醫(yī)學信息學領域的知名教授之一,現(xiàn)任南通大學醫(yī)學信息學系主任、數(shù)字醫(yī)學研究所所長,兼任中華醫(yī)學會醫(yī)學信息學會常委等職。據(jù)董建成教授介紹,南通醫(yī)學院早在2002年就開設醫(yī)學信息學本科專業(yè)方向,是在綜合分析了國內(nèi)外相關發(fā)展信息的基礎上作出的抉擇。其后歷經(jīng)了“非典”、汶川地震和我國新醫(yī)改的推動,不但證實了當初選擇的正確性,而且即使在當今的信息化時代,也具有重要戰(zhàn)略意義。
明確目標:確立醫(yī)學信息學專業(yè)教育方向
醫(yī)學信息學(Medical Informatics)是一門典型的交叉學科,涉及到生物醫(yī)學、信息科學、計算機科學技術和管理科學等學科。說到這里,就不得不說董建成教授的教育背景了,董建成教授是1977年我國恢復高考后南通醫(yī)學院醫(yī)學系第一屆大學生,經(jīng)過五年的臨床醫(yī)學理論和實踐學習后獲得醫(yī)學學士學位,畢業(yè)后留在了南通醫(yī)學院任教。“一晃幾年過去了,當時總覺得除了不斷地學習和工作之外,我還應該再做點兒事業(yè)”,董建成教授如是說。就在這種“做點兒事業(yè)”的信念下,董建成教授考取了北京大學信息管理學院的研究生。在北大,他如魚得水,穿梭于不同的學院,白天聽課、做實驗,晚上還經(jīng)常來往于清華、人大等不同的院校去聽講座和學術報告。也是從那時起,他開始接觸醫(yī)學信息學這個獨特的學科。
1. 深入學習,立志從事醫(yī)學信息學事業(yè)
“我是學醫(yī)的,當時我就想如果將醫(yī)學知識和信息技術結(jié)合起來,一定能夠提高臨床診斷和治療的效率,避免不少醫(yī)療差錯。”董建成教授說,“這個思想在以后很長的一段時間中都對我影響很大。”
之后,得益于北大課程的開放性,董建成教授不但讀完了信息管理學的全部課程,還在北大計算機科學與技術學院修讀了大量的計算機課程。“那時對知識的欲望已經(jīng)到了如饑似渴的地步。當時協(xié)和醫(yī)大的本科生前三年是在北大讀的,我就跟著他們聽生物醫(yī)學工程、醫(yī)學電子學等課程。”雖然當時非常辛苦,但董建成教授坦言那時的學習是他收獲最大的階段。
在導師的指導下,董建成教授看到了交叉學科的發(fā)展前景。他的畢業(yè)論文選擇了《艾滋病數(shù)據(jù)庫的建立與信息學分析》,建立了當時最全的艾滋病文獻數(shù)據(jù)庫,并開展了一系列的相關研究。“我把畢業(yè)論文工作當作我醫(yī)學信息學研究的第一次實踐,投入了我的全部時間和精力。從那個時候起,我真正感覺到了我這一生的‘一點兒事業(yè)’,就是要把醫(yī)學和信息科學結(jié)合起來。”
2. 目標明確后,開墾醫(yī)學信息學荒地
從北大研究生畢業(yè)后,董建成教授回到了南通醫(yī)學院,在“立志從事醫(yī)學信息學事業(yè)”的信念下,他于1992年在南通創(chuàng)建了國內(nèi)第一個醫(yī)學信息學會,一年后,中華醫(yī)學會增設了醫(yī)學信息學分會。從此,我國的醫(yī)學信息學研究從傳統(tǒng)的圖書館學、情報學領域開始了朝向臨床醫(yī)學和數(shù)字醫(yī)學的邁進。
董建成教授組建的醫(yī)學信息學研究團隊,在學校的支持下,于1996年成立了國內(nèi)醫(yī)學院校中第一個“醫(yī)學信息學教研室”。并在其后的國內(nèi)外相關學術交流中,開展了醫(yī)學信息學的研究內(nèi)容、方法、技術等多方面的探索,確立開設醫(yī)學信息學專業(yè)培養(yǎng)專門人才的思想。通過整合學校的臨床醫(yī)學、基礎醫(yī)學、公共衛(wèi)生學、計算機科學、管理學等多方資源,于2002年通過教育部組織的專家論證,正式開設了醫(yī)學信息學專業(yè)方向,面向全國招收本科生,成為了國內(nèi)第一所面向臨床和醫(yī)院信息化開展醫(yī)學信息學教育的高等院校。國家教育部隨后在《普通高等學校本科專業(yè)目錄》外增添了醫(yī)學信息學專業(yè),專業(yè)代碼為070408W。加快了我國的醫(yī)學信息學教育與國際接軌的步伐。
持之以恒:完善醫(yī)學信息學專業(yè)教學內(nèi)容
在國內(nèi),面向臨床的醫(yī)學信息學專業(yè)教學沒有先例。董建成教授的團隊于2000年就開始到美國、歐洲、澳大利亞等國考察其專業(yè)教學體系的建設。從教學內(nèi)容、課程設置、教學方法,直至師資配備、教材建設、實驗指導、生產(chǎn)實習等各個環(huán)節(jié)進行了全面的調(diào)查和分析。建立了適合當時國情的醫(yī)學信息學專業(yè)教學體系,為其后醫(yī)學信息學專業(yè)教育的快速發(fā)展奠定了基礎,也為我國其他高等院校開展醫(yī)學信息學專業(yè)教育進行了有益的探索。
1. 教學體系建設是培養(yǎng)合格人才的基礎
董建成教授對記者說:“在確立醫(yī)學信息學專業(yè)教學體系后,師資力量是辦好醫(yī)學信息學專業(yè)的基本保障。”面對當初師資力量不足的局面,董建成教授利用自己在東南大學計算機科學與工程學院做高級訪問學者的機會,一邊提高自己,一邊堅持教學,還一邊在南京的高校中“大肆地‘挖’人、‘搶’人”,先后從南京大學、東南大學、中國礦業(yè)大學以及日本德島大學引進博士、碩士若干人。同時通過自身培養(yǎng)和送出去培養(yǎng)等多種方式,確保了該專業(yè)師資力量的可持續(xù)發(fā)展。
在專業(yè)教學課程的設置上,董建成教授說,南通大學醫(yī)學信息學專業(yè)的課程設計參考了八所國外高校的課程內(nèi)容,是在醫(yī)學信息學專業(yè)教學委員會和國內(nèi)其他知名專家的論證后確定的,不僅包含有國外的原版教材、國內(nèi)的統(tǒng)編教材和規(guī)劃教材,也有該系自己主編并在人民衛(wèi)生出版社、東南大學出版社出版的自編教材,如《醫(yī)學信息學概論》、《醫(yī)學信息檢索教程》等,后者在2009年獲得國家級精品教材。本科生主修的學位課程覆蓋了信息技術、臨床醫(yī)學、基礎醫(yī)學、管理科學等多個領域,確保了醫(yī)學信息學專業(yè)畢業(yè)生知識結(jié)構(gòu)的科學性和實用性。
2. 動手能力培養(yǎng)是醫(yī)療衛(wèi)生信息化的急需
考慮到大四的學生在醫(yī)院實習期間不能操作醫(yī)院信息系統(tǒng)的現(xiàn)實,如何將學生的理論知識轉(zhuǎn)化為實際應用能力是學校急需考慮的問題。有鑒于此,董建成教授又于2006年率先建立了國內(nèi)第一個醫(yī)院信息系統(tǒng)(HIS)模擬實驗室,由于教學效果顯著,該實驗室于2007年獲得了中央與地方共建實驗室的200萬元資助,使得南通大學醫(yī)學信息學專業(yè)的實驗教學條件如虎添翼,受到了國內(nèi)外同行的關注。
“我們在后續(xù)的項目資助下,將原有的實驗室擴大為數(shù)字醫(yī)學實驗室,成立了南通大學數(shù)字醫(yī)學研究所,為研究生的培養(yǎng)提高了更好的條件。”據(jù)董建成教授介紹,他們的下一個目標就是如何讓醫(yī)學信息學教育真正與國際接軌,真正面向當前的實際應用,探索符合中國國情的醫(yī)學信息學人才培養(yǎng)之路。
面向應用:不斷探索醫(yī)學信息學創(chuàng)新之路
以省市教育現(xiàn)代化建設發(fā)展為契機,學習、樹立、落實科學發(fā)展觀,用教育信息化帶動教育現(xiàn)代化。電教中心以振奮精神、實事求是、腳踏實地、全心服務于教育的工作姿態(tài),以“扎實研究,實用培訓,嚴格管理,優(yōu)質(zhì)服務”為載體,促進新課改的深入,促進教師信息素質(zhì)的提高和專職骨干教師隊伍形成,促進教育教學質(zhì)量的提升,為秦淮教育做出貢獻。
二、主要工作:
(一)課題引領,教科研并重,扎實推進教育技術工作
1、做好省級教育技術實驗學校“十五”電教課題結(jié)題工作
省級教育技術實驗學校,示范學校要加強“窗口學校”的示范作用,加強研究成果的宣傳與推廣,并將有關教育技術活動上傳到市教育技術研究網(wǎng)上。必須謀劃“十一·五”課題的申報工作。
2、加強信息學科教學研究,強化學科管理
(1)積極參與學科教學視導,深入學校聽課調(diào)研、課堂教學,學生學習狀況,教研組建設和管理等現(xiàn)狀,特別組織好高中新課程標準的學習,落實、計劃組織全區(qū)高中研究課兩次。
(2)針對新學期小學、初中、高中信息學科教材重新變動,每兩周組織一次有效的教研活動,做到有計劃,有目的,有實效和有反饋,通過集體備課,專題講座,觀摩研討等活動,加強教師們之間的交流合作,解決實際問題,安排全區(qū)小學研究課兩次,初中研究課一次。
(3)組織小學信息學教研片,將以東片和西片(含城外)設立片級教研網(wǎng),確定東、西片召集人,并開展片級活動。
(4)組織好高二信息技術省級“會考”工作(10月15日~16日)
(5)組織小學、中學信息學科優(yōu)質(zhì)課評比,推薦優(yōu)秀選手參加市比賽。
3、積極探索信息技術與學科整合
網(wǎng)絡環(huán)境下的課堂教學是課堂教學信息化的一種模式,有利于學生自主學習、知識重建和探究性學習等作用。各校要充分發(fā)揮網(wǎng)絡(機房)作用,利用現(xiàn)有教學資源,進行網(wǎng)絡環(huán)境下的“教”與“學”,本學期全區(qū)小學、幼兒園分別進行網(wǎng)絡下的學科“整合”研討活動。
(二)繼續(xù)開展教師培訓,提高教師應用教育技術的技能
1、舉辦中小學幼兒園教師課件(網(wǎng)件)制作培訓班,要求,每校推薦一名教師,第三周報名,第四周開班,上課時間每周二下午2:00-5:00,培訓,資料費150元/人。
2、組織部分教師參加市、省級網(wǎng)絡管理培訓班,主要對象是專職計算機教師,并逐步實現(xiàn)網(wǎng)管教師“持證上崗”。
3、配合有關學校的校本培訓工作,包括提供技術指導及專題性講座等。
(三)加強管理,優(yōu)質(zhì)服務,做好教育信息化工作
1、繼續(xù)及時維護、更新秦淮教育網(wǎng)站(含進修學校的網(wǎng)站),繼續(xù)推進網(wǎng)上“政務辦公”和資料、信息的網(wǎng)上傳遞。宣傳秦淮教育動態(tài)、信息、配合區(qū)教育局城域網(wǎng)站的籌建工作。
2、積極配合基層學校寬帶接入工作和學校網(wǎng)站(網(wǎng)頁)制作,進一步強化“教育一線通”的信息應用工作。
3、督促、檢查學校“文明網(wǎng)絡室”開放工作,提倡周六,周日讓學生“進機房,用機房”。指導各校抓好信息技術的課外活動。
4、加強資源建設,做好“信息資源費”的收費工作。充分用好“一費制”中的“信息資料建設費”政策,為各學校征訂有用、實用的電教教材軟件。各學校要嚴格執(zhí)行義務教育階段學生文字教材中配套磁帶(小學三年級-六年級,初中學生)的征訂工作,要嚴格執(zhí)行資源建設費,(原電教代辦費中80%部分,即小學4.8元/人、中學(含高中)6.4元/人)的收繳工作,力求做到開學后一個月內(nèi)上交區(qū)進修學校會計室。各學校的信息技術費,在帳目上要設獨立科目,做到專款專用,年底對信息技術費的使用進行抽檢,違規(guī)學校不予年審或取消收費資格。
(四)幾項重要工作
1、組織全區(qū)教育技術(電教)論文的評比工作(9月25日截止),推薦優(yōu)秀論文參加市級評比。
2、市中小學網(wǎng)絡文明夏令營的活動總結(jié)表彰工作。
3、市、區(qū)中小學信息技術與課程整合教學設計暨CAI優(yōu)秀教案(課件)評比表彰會。